Mol Psychiatry:基于瑞典 BASIC 队列的转录组分析,揭示围产期抑郁不同轨迹的基因表达特征
2025-06-10 xiongjy MedSci原创 发表于上海
妊娠期抑郁症状与免疫相关基因的下调显著相关,而产后新发抑郁与ISG15和RSAD2基因的上调相关。妊娠期样本中未发现与产后新发抑郁相关的显著DEGs,但假设验证分析支持了免疫基因在产后抑郁中的作用。
妊娠期和产后抑郁(围产期抑郁)对母婴健康具有深远影响,但其生物学机制尚不明确。本研究旨在通过转录组学分析,揭示妊娠期和产后抑郁症状的分子特征。研究基于瑞典BASIC队列,采集了妊娠晚期和产后早期的血液样本,通过RNA测序技术检测mRNA表达水平,并结合爱丁堡产后抑郁量表(EPDS)评估抑郁症状。研究设计包括比较不同抑郁症状轨迹组(如仅妊娠期抑郁、产后新发抑郁和持续性抑郁)与对照组的基因表达差异,以及分析EPDS评分与基因表达的相关性。此外,研究还通过基因集富集分析(GSEA)探索了差异表达基因(DEGs)的生物学功能,并验证了既往研究中与产后抑郁相关的候选基因。
在方法上,研究纳入了117名妊娠期和188名产后女性的血液样本,通过RNA测序技术获取转录组数据。样本采集后,使用PAXgene管保存并提取RNA,随后进行文库构建和测序。数据分析采用DESeq2进行差异表达分析,校正了年龄和体重指数(BMI)的潜在影响。研究重点关注蛋白编码基因,并通过GO富集分析和KEGG通路分析揭示DEGs的生物学功能。此外,研究还针对既往报道的产后抑郁相关基因(如ISG15和RSAD2)进行了假设验证分析。
研究结果显示,妊娠期抑郁症状与免疫相关基因的下调显著相关。在妊娠期样本中,仅妊娠期抑郁组和持续性抑郁组分别有18个和10个基因显著下调,其中CNN2基因在两组中均下调。这些基因主要参与白细胞迁移、趋化作用和细胞因子信号通路。此外,妊娠32周时的EPDS评分与125个DEGs相关(16个上调,109个下调),这些基因同样富集于免疫反应和细胞运动相关通路。值得注意的是,妊娠期样本中未发现与产后新发抑郁相关的显著DEGs,但在假设验证分析中,免疫相关基因ISG15和RSAD2在产后新发抑郁组中显著上调,这一结果与既往研究一致。产后样本的分析显示,产后6周的EPDS评分与4个DEGs相关(2个上调,2个下调),但不同抑郁轨迹组间的基因表达差异不显著。
图1:研究设计示意图
最后研究指出,妊娠期抑郁症状与免疫相关基因的下调密切相关,而产后新发抑郁则与特定免疫基因的上调相关。这些发现支持了围产期抑郁与免疫系统失调的关联,但未能通过转录组标记物单独预测产后抑郁风险。未来研究需结合更大样本和多组学数据,以进一步阐明其分子机制,并为早期干预提供潜在靶点。
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好文章,谢谢分享。
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